| Un equipo científico ha desarrollado un sistema de análisis genético combinatorio que ofrece información más completa y rápida que los métodos clásicos, y que permite reconocer las complejas interconexiones funcionales entre genes que encierran procesos celulares como la cicatrización o la metástasis. El trabajo publicado en la revista Science, describe un análisis combinatorio en células de cultivo de la actividad de la proteína JNK, implicada en procesos de migración, muerte celular y respuesta a estrés. Enrique Martín Blanco, del Instituto de Biología Molecular de Barcelona, indica que las respuestas celulares del organismo (por ejemplo, un proceso de cicatrización o de metástasis) esconden complejas redes de señalización celular interconectadas entre sí. Hasta el momento, los análisis genéticos utilizados para desentrañar estos procesos no siempre definen la función de los genes involucrados, explicó. “Aunque los análisis genéticos clásicos han conseguido identificar los genes esenciales implicados en las redes de señalización, normalmente no proporcionan mucha información sobre las relaciones funcionales que existen entre estos componentes", afirmó Martín Blanco. El investigador ejemplificó esta idea: “los análisis genéticos clásicos pueden determinar que si se desactiva el gen A, el gen B responde. Sin embargo, no describen por qué B realiza esta respuesta". Según Martín Blanco, el análisis combinatorio descrito constituye un avance en el estudio del genoma a través de la biología de sistemas. Esta disciplina, a diferencia de métodos empíricos clásicos, emplea modelos matemáticos que describen el comportamiento del objeto en estudio como una red compleja. Su desarrollo, que despuntó a principios de este siglo, puede dar lugar a aplicaciones en la farmacología y en la biomedicina. La técnica desarrollada sigue esta línea y ha conseguido identificar de forma rápida y directa sistemas de conexiones funcionales que regulan la señalización celular. Se ha definido una red combinatoria de cascadas de señalización implicadas en la activación de JNK, una quinasa que está relacionada con procesos de cicatrización e invasividad celular en ciertos tipos de cáncer. Para ello, se sirvieron de un biosensor capaz de detectar la actividad de la JNK mediante un cambio cromático. Mediante interferencia a nivel de ARN, se analizaron los diferentes cambios de color en la célula en un análisis de 18 mil combinaciones genéticas. Al combinar los datos, lograron crear un algoritmo matemático que les permitió construir la red de conexiones funcionales controlando la cascada de JNK. El método es extrapolable a otros modelos, ya que sólo basta desarrollar el biosensor adecuado. Los resultados que ofrece el análisis tienen un alto valor predictivo, que evitan partir de cero cuando se analicen procesos complejos en los que la JNK sea un elemento clave. En el proyecto han colaborado científicos del Consejo superior de Investigaciones Científicas (España), de la Universidad de Harvard (Estados Unidos), del Instituto de Investigación del Cáncer de Londres y del Hospital Monte Sinaí de Toronto (Canadá). Science: http://www.sciencemag.org/ Fuente: Madrid, octubre 17/2008 (EFE) |
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