| Un equipo de investigadores internacionales, con participación del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), ha desarrollado un nuevo sistema de análisis combinatorio que ofrece información más completa y rápida que los métodos de análisis genéticos clásicos, según informa el CSIC en un comunicado. El trabajo, que aparece publicado en "Science", describe un análisis combinatorio en células de cultivo de la actividad de la proteína JNK, implicada en procesos de migración, muerte celular y respuesta al estrés. Los resultados que ofrece el análisis tienen asimismo un alto valor predictivo, que evitan partir de cero cuando se analicen procesos complejos en los que la JNK sea un elemento clave. Hasta el momento, los análisis genéticos utilizados por la comunidad científica para desentrañar estos procesos no siempre definen la función de los genes involucrados. "Aunque los análisis genéticos clásicos han conseguido identificar los genes, normalmente no proporcionan mucha información sobre las relaciones funcionales que existen entre estos componentes", explica el Dr. Enrique Martín Blanco, miembro del Instituto de Biología Molecular de Barcelona (CSIC) del Parque Científico de Barcelona. El análisis combinatorio descrito constituye "un paso más allá" en el estudio del genoma a través de la biología de sistemas, según el Dr. Martín Blanco. Así, emplea modelos matemáticos que describen el comportamiento del objeto en estudio como una red compleja. En concreto, han definido una red combinatoria de cascadas de señalización implicadas en la activación de JNK, una cinasa que ha centrado los trabajos del equipo de Martín Blanco y que está relacionada con procesos de cicatrización e invasividad celular en ciertos tipos de cáncer. Para ello, se sirvieron de un biosensor capaz de detectar la actividad de la JNK mediante un cambio cromático. Mediante interferencia de ARN, analizaron los diferentes cambios de color en la célula en un análisis de 18.000 combinaciones genéticas. Después, combinando los datos, lograron crear un algoritmo matemático que les permitió construir la red de conexiones funcionales controlando la cascada de JNK. En el estudio, en el que también participa la investigadora del CSIC Flora Llense, colaboran científicos de la Universidad de Harvard (Estados Unidos), el Instituto de Investigación del Cáncer de Londres (Reino Unido) y el Hospital Mount Sinai de Toronto (Canadá). Science 2008;322:453-456 |
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